Solo se me ocurre una cosa. Hay ocasiones en que el ofrmato que da
windows a las sd no es reconocido por los teléfonos.
Como ya tienes
root, supongo que también habrás instalado un
recovery. Yo te hablo del
CWM, que es el que conozco.
Copia todos los datos de la tarjeta a un pc. Inicia en recovery, y vete a la opción "advanced". (Para pasar los datos al pc, y luego a la tarjeta, mejor que la extraigas y utilices un lector de tarjetas en lugar del usb del teléfono. Aunque parezcan lo mismo, es más rápido, y si son muchos datos te vendrá mejor).
Selecciona la opción "partition sdcard", y selecciona el valor mínimo para la partición ext y cero para el swap. Una vez termine de formatear, vuelve a pasar los datos del pc a la tarjeta, y reinicia el teléfono.
El valor mínimo para la ext es de 128 Mb, por lo que no pierdes mucho espacio. Aún así, si la tarjeta es de poca capacidad, puedes utilizar un progrma llamado "MiniTool Partition Wizard" para eliminar la partición ext y ampliar la principal (fat) a toda la tarjeta.