Pruebalo a ver si te sirve, puedes hacerlo desde el móvil también, simplemente subes el video, ajustas el inicio y el fin y le pulsas para que haga el corte, cuando esté listo, te da la opción a bajarlo
Con el video no hay peligro, todo se hace en tu navegador, cuando se trata el recorte, se sube temporalmente al VPS, lo corta, te lo ofrece en el navegador y cuando sales (lo bajes o no) se borra.