yo he probado flyme tools y algunas funciones de gravity box y sin problemas
si que es verdad que he encontrado un pequeño bug en el flyme tools. cuando cambias el numero de columnas o filas del launcher aumentandolas, si luego las reduces pierdes las apps que tenias ocupando los espacios adicionales. Siguen instaladas pero el laucher no las muestra, lo que sin un factory reset no tiene solucion(o no encuentro) en la version 1.4.9 de flyme tools.
respecto al modulo que comentas pues mas de lo mismo...flyme no es una rom que se adapte a las caracteristicas de los modulos xposed tal y como una AOSP lo haria..