Prueba una cosa, elimina el archivo, reinicia en recovery y haz un factory reset a ver.La rom te lo tendría que recrearRevisados los archivos citados, está correcto (mtp). Reinstalado backup de twrp. Sigue sin funcionar
En windows, el tema drivers puede ser muy puñetero, pero que no te lo vea en xubuntu, ni siquiera en recovery es muy raro.