Pues si lees lo que hicimos en su dia en el hilo del desbloqueo de bootloader verás que, siguiendo el método que decidimos llamar en este foro el método de Tiode, pusimos la cuenta Mi en ajustes cuenta MI y no desde opciones de desarrollador. Si la pones así no deberías tener ningún problema. Poniéndola desde opciones de desarrollador no funcionaba el método de Tiode y lo que pasaba es que había que esperar las 360 horas. Como eso hoy ya no es problema, porque hay que esperar las 360 horas, da igual desde dónde se ponga la cuenta en el móvil.
No va a ser ni bueno, ni malo. Como mucho va a ser necesario ponerla.
Edito: Como dice
@blood yo la quito siempre antes de hacer cambios de rom. Aunque hay compañeros que no la quitan y no tenían problemas.
Saludos