Que quieres extraer el system?, yo lo hago por comandos adb, extraigo un system.img que luego con un programilla lo convierto en csrpetas.Hey me harias el favor de pasarme la herramienta para extraer la rom entera y editarla ya que el que tengo creo que es un poco viejo y me marca errores de exepcion de java etc....
Si es eso lo que quieres dímelo y en un rato te lo pasó.