Si yo tampoco hago Backup's de aplicaciones yo las hago del Sistema con TWRP.Yo no suelo menear apps de memoria interna a externa, ni hacer backups con apps tipo Titanium de las apps. Salvo la copia en mi cuenta de Google del wats, todo lo instalo de cero. Es lo mejor para evitar problemas.
Yo tampoco meneo apps de interna a externa, salvo rara la excepción, simplemente elimino; y como en 64 + 128GB no suelo tener problemas de almacenamiento pues aparte de lo eliminado no suelo pasar ya absolutamente nada y lo dejo donde se instalen.