Creo que te has liado un pelin , pero porlo que comentas tan solo te falta un pequeño detalle para ser root . A traves de las flashtools lo que haces es flashear el custom recovery , que por si mismo no te hace root pero si es la herramienta para lograrlo.
Ahora debes descargarte el zip del supersu SuperSU Download y pasarlo a la raiz del almacenamiento del movil . Una vez hecho esto , apagas el movil y lo arrancas en modo recovery , pulsando la tecla de volumen+ y la de encendido simultaneamente. Una vez dentro del recovery escogeras la opcion "install zip" y guias al sistema hasta el archivo que del supersu que previamente habias pasado al movil . Una vez hecho esto , cuando hayas reiniciado ya seras root .
