Hola!
Deberias decir con que ROM te pasa, para tener mas datos.
Dices que reinstalaste, pero no dices cual.
Intento contestarte, segun creo lo que te ha pasado.
La carpeta Whatsapp, y la de las fotos, las debes copiar y pasar a la sd externa antes de flashear ninguna rom por FT o
recovery, ya que se borra el almacenamiento interno.
Una vez instalada, debes volverla a pasar al almacenamiento interno, al menos la del Wap, si no, no te la reconoce, y lo sabras por que si tienes fotos en los chats, estas te apareceran borrosas.
Para que las fotos de las camaras vayan a la sd externa, debes elegir el lugar donde quieres guardarlas desde la misma apk de la camara, desde los ajustes de la apk, aunque tengas en almacenmiento en el menu Ajustes del telefono la SD externa, las fotos no iran a ella si no lo eliges desde la apk de camara que uses.
SAlu2!