Es extraño después de hacerle un hard reset, debería de quedar como el primer dia, sin aplicaciones instaladas etc..
Eso no vale, y no es tan extraño, si pensáis en que solamente quedan 3GB para el usuario, si se devuelve a fábrica quedarán esos 3GB pero comenzarán a actualizarse todas las aplicaciones por lo que puede quedarse sin espacio igualmente solamente con las de Sistema sin instalar nada más, y si le comienzan a caer todas las aplicaciones de usuario además de las de Sistema (hay que quitar la opción de que se actualice automáticamente con todas las aplicaciones instaladas por el usuario, cuenta de google si mal no recuerdo) está en un más de lo mismo, pero aún peor.Prueba a reinstalar el firm.
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El teléfono a estas alturas tiene una memoria interna ínfima, y lo que queda para el usuario aún menos, si mal no recuerdo en android 5/5.1 el firmware ya pesaba por sí solo, y por lo bajo, unos 6GB, sumar actualizaciones de las aplicaciones de Sistema, aún reseteando a fábrica y dejándolo sin más, se queda sin espacio a la más mínima y ya digo que esto puede sucederle simplemente con las de Sistema, necesidad de root o de eliminar aplicaciones de Sistema sí o sí, y sabiendo lo que elimina.