@Matrushko haz backup de las aplicaciones con Titanium Backup y no restaures nada más de la anterior ROM en la nueva que vayas a instalar ya que si restauras algo, lo más probable es que restaures también configuraciones o incluso toda la ROM anterior.
El proceso sería:
Instalas Titanium Backup desde el Play Store.
Haces backup de las aplicaciones que desees en la SD.
Instalas la nueva ROM y haces los correspondientes wipes.
Una vez en la nueva ROM configuras tu cuenta de Google.
Instalas Titanium Backup de nuevo desde Play Store.
Restauras la copia de seguridad anterior.
Es la manera más segura de mantener las aplicaciones actuales en tu nueva ROM. No recomiendo para nada hacer backup de configuraciones del sistema y restaurarlas después, ya que en muchos casos esas configuraciones cambian con las nuevas versiones y podrían dar conflictos en la nueva.
Suerte